Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDCD2Q16342 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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