Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
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