Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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