Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
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