Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 SHMT2-212ENST00000554467 3416 ntTSL 212.11□□□□□ -0.474e-8■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.063e-7■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.113e-7■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 OCRL-204ENST00000486673 942 ntTSL 510.11□□□□□ -0.793e-7■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 TBC1D9B-216ENST00000522224 532 ntTSL 517.14■□□□□ 0.337e-7■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.337e-7■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.235e-7■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 UBXN6-203ENST00000587009 1967 ntTSL 221.36■■□□□ 1.011e-7■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 UBXN6-205ENST00000588238 4598 nt15.42■□□□□ 0.061e-7■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 CPSF7-221ENST00000543545 495 ntTSL 510.01□□□□□ -0.811e-7■■■■■ 43.9
EFTUD2Q15029 CPSF7-215ENST00000536145 546 ntTSL 47.29□□□□□ -1.241e-7■■■■■ 43.9
EFTUD2Q15029 CPSF7-224ENST00000544990 646 ntTSL 36.99□□□□□ -1.291e-7■■■■■ 43.9
EFTUD2Q15029 USP14-208ENST00000582707 1803 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.266e-7■■■■■ 43.9
EFTUD2Q15029 USP14-202ENST00000383589 2168 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.496e-7■■■■■ 43.9
EFTUD2Q15029 USP14-203ENST00000400266 1681 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.556e-7■■■■■ 43.9
EFTUD2Q15029 USP14-205ENST00000578942 3189 ntTSL 211.22□□□□□ -0.616e-7■■■■■ 43.9
EFTUD2Q15029 USP14-201ENST00000261601 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.026e-7■■■■■ 43.9
EFTUD2Q15029 TMEM55B-205ENST00000554028 1118 ntTSL 210.43□□□□□ -0.745e-7■■■■■ 43.9
EFTUD2Q15029 PIDD1-207ENST00000528122 577 ntTSL 314.96□□□□□ -0.017e-10■■■■■ 43.9
EFTUD2Q15029 LRP1-210ENST00000556247 611 ntTSL 317.24■□□□□ 0.355e-11■■■■■ 43.9
EFTUD2Q15029 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.393e-7■■■■■ 43.8
EFTUD2Q15029 C16orf87-204ENST00000565112 879 ntTSL 521■□□□□ 0.953e-7■■■■■ 43.8
EFTUD2Q15029 HIP1R-209ENST00000538236 1176 ntTSL 315.86■□□□□ 0.133e-7■■■■■ 43.8
EFTUD2Q15029 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.363e-7■■■■■ 43.8
EFTUD2Q15029 KSR1-206ENST00000577823 685 ntTSL 510.08□□□□□ -0.84e-8■■■■■ 43.8
EFTUD2Q15029 PLEKHJ1-207ENST00000588356 610 ntTSL 423.31■■□□□ 1.322e-7■■■■■ 43.8
EFTUD2Q15029 SSBP4-203ENST00000593641 900 ntTSL 521.04■□□□□ 0.966e-8■■■■■ 43.8
EFTUD2Q15029 E2F4-206ENST00000565849 639 ntTSL 325.6■■□□□ 1.696e-7■■■■■ 43.8
EFTUD2Q15029 E2F4-202ENST00000561904 897 ntTSL 316.37■□□□□ 0.216e-7■■■■■ 43.8
EFTUD2Q15029 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.886e-7■■■■■ 43.8
EFTUD2Q15029 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.836e-7■■■■■ 43.8
EFTUD2Q15029 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.696e-7■■■■■ 43.8
EFTUD2Q15029 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.546e-7■■■■■ 43.8
EFTUD2Q15029 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.426e-7■■■■■ 43.8
EFTUD2Q15029 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.246e-7■■■■■ 43.8
EFTUD2Q15029 NDRG2-271ENST00000557353 1919 ntTSL 216.3■□□□□ 0.26e-7■■■■■ 43.8
EFTUD2Q15029 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.26e-7■■■■■ 43.8
EFTUD2Q15029 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.196e-7■■■■■ 43.8
EFTUD2Q15029 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.156e-7■■■■■ 43.8
EFTUD2Q15029 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.136e-7■■■■■ 43.8
EFTUD2Q15029 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.126e-7■■■■■ 43.8
EFTUD2Q15029 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.14e-7■■■■■ 43.8
EFTUD2Q15029 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.046e-7■■■■■ 43.8
EFTUD2Q15029 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.197e-7■■■■■ 43.8
EFTUD2Q15029 NDRG2-260ENST00000556974 1012 ntTSL 513.24□□□□□ -0.295e-7■■■■■ 43.8
EFTUD2Q15029 NDRG2-274ENST00000557633 527 ntTSL 311.43□□□□□ -0.584e-7■■■■■ 43.8
EFTUD2Q15029 NDRG2-210ENST00000397856 1309 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.656e-7■■■■■ 43.8
EFTUD2Q15029 NDRG2-240ENST00000555026 1162 ntTSL 510.54□□□□□ -0.725e-7■■■■■ 43.8
EFTUD2Q15029 NDRG2-212ENST00000403829 1500 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.726e-7■■■■■ 43.8
EFTUD2Q15029 NDRG2-250ENST00000556008 1051 ntTSL 59.51□□□□□ -0.896e-7■■■■■ 43.8
EFTUD2Q15029 NDRG2-253ENST00000556366 772 ntTSL 58.56□□□□□ -1.045e-7■■■■■ 43.8
EFTUD2Q15029 NDRG2-278ENST00000635386 672 ntTSL 35.94□□□□□ -1.465e-7■■■■■ 43.8
EFTUD2Q15029 PRKCSH-211ENST00000590098 795 ntTSL 216.7■□□□□ 0.267e-9■■■■■ 43.7
EFTUD2Q15029 PRKCSH-204ENST00000587290 780 ntTSL 214.08□□□□□ -0.167e-9■■■■■ 43.7
EFTUD2Q15029 REEP4-203ENST00000518664 996 ntTSL 217.57■□□□□ 0.44e-7■■■■■ 43.7
EFTUD2Q15029 REEP4-204ENST00000519074 1212 ntTSL 217.55■□□□□ 0.44e-7■■■■■ 43.7
EFTUD2Q15029 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.171e-7■■■■■ 43.7
EFTUD2Q15029 APOE-204ENST00000446996 737 ntTSL 221.25■□□□□ 0.991e-7■■■■■ 43.7
EFTUD2Q15029 APOE-203ENST00000434152 864 ntTSL 219.49■□□□□ 0.711e-7■■■■■ 43.7
EFTUD2Q15029 APOE-205ENST00000485628 771 ntTSL 1 (best)15.67■□□□□ 0.11e-7■■■■■ 43.7
EFTUD2Q15029 AP3M2-213ENST00000522288 574 ntTSL 420.67■□□□□ 0.97e-8■■■■■ 43.7
EFTUD2Q15029 AP3M2-204ENST00000517865 2778 ntTSL 1 (best)19.95■□□□□ 0.787e-8■■■■■ 43.7
EFTUD2Q15029 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.037e-8■■■■■ 43.7
EFTUD2Q15029 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.097e-8■■■■■ 43.7
EFTUD2Q15029 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.097e-8■■■■■ 43.7
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EFTUD2Q15029 AP3M2-217ENST00000530375 1212 ntTSL 1 (best)11.86□□□□□ -0.517e-8■■■■■ 43.7
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EFTUD2Q15029 AP3M2-208ENST00000520685 478 ntTSL 36.04□□□□□ -1.447e-8■■■■■ 43.7
EFTUD2Q15029 INO80D-202ENST00000414320 753 ntTSL 310.93□□□□□ -0.661e-6■■■■■ 43.7
EFTUD2Q15029 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.451e-6■■■■■ 43.7
EFTUD2Q15029 POLRMT-206ENST00000590709 1106 ntTSL 215.35■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 43.7
EFTUD2Q15029 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.279e-10■■■■■ 43.6
EFTUD2Q15029 ATP6V1B2-206ENST00000523482 6907 ntTSL 26.56□□□□□ -1.369e-10■■■■■ 43.6
EFTUD2Q15029 RPS21-202ENST00000370562 1002 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.53e-19■■■■■ 43.6
EFTUD2Q15029 RPS21-204ENST00000450116 418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.684e-19■■■■■ 43.6
EFTUD2Q15029 SMPD4-207ENST00000435455 842 ntTSL 515.5■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 43.6
EFTUD2Q15029 KAT2A-203ENST00000586972 852 ntTSL 219.46■□□□□ 0.712e-7■■■■■ 43.6
EFTUD2Q15029 TFDP1-203ENST00000453989 792 ntTSL 322.72■■□□□ 1.231e-6■■■■■ 43.6
EFTUD2Q15029 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.051e-7■■■■■ 43.6
EFTUD2Q15029 TFDP1-206ENST00000475254 804 ntTSL 317.87■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 43.6
EFTUD2Q15029 TFDP1-205ENST00000465174 955 ntTSL 312.53□□□□□ -0.41e-6■■■■■ 43.6
EFTUD2Q15029 PGS1-205ENST00000586355 584 ntTSL 411.12□□□□□ -0.633e-17■■■■■ 43.6
EFTUD2Q15029 PGS1-203ENST00000586019 572 ntTSL 49.23□□□□□ -0.933e-17■■■■■ 43.6
EFTUD2Q15029 SENP3-210ENST00000619785 634 ntTSL 36.52□□□□□ -1.373e-17■■■■■ 43.6
EFTUD2Q15029 MYBBP1A-205ENST00000571368 1995 ntTSL 219.02■□□□□ 0.645e-7■■■■■ 43.6
EFTUD2Q15029 RNF213-202ENST00000411702 6428 ntTSL 212.65□□□□□ -0.383e-7■■■■■ 43.6
EFTUD2Q15029 RPS21-205ENST00000492356 429 ntTSL 1 (best)11.44□□□□□ -0.582e-19■■■■■ 43.6
EFTUD2Q15029 RPS21-201ENST00000343986 344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.962e-19■■■■■ 43.6
EFTUD2Q15029 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.783e-7■■■■■ 43.5
EFTUD2Q15029 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.83■□□□□ 0.63e-7■■■■■ 43.5
EFTUD2Q15029 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.543e-7■■■■■ 43.5
EFTUD2Q15029 CD99P1-202ENST00000430562 984 ntTSL 1 (best)8.41□□□□□ -1.063e-7■■■■■ 43.5
EFTUD2Q15029 SETD6-205ENST00000422445 1739 ntTSL 525.04■■□□□ 1.61e-10■■■■■ 43.5
EFTUD2Q15029 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 43.5
EFTUD2Q15029 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.274e-9■■■■■ 43.5
EFTUD2Q15029 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.23e-9■■■■■ 43.5
EFTUD2Q15029 PPT2-254ENST00000493548 790 ntTSL 520.43■□□□□ 0.863e-9■■■■■ 43.5
EFTUD2Q15029 PPT2-EGFL8-207ENST00000585246 1051 ntAPPRIS ALT2 TSL 220.26■□□□□ 0.834e-9■■■■■ 43.5
EFTUD2Q15029 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.563e-9■■■■■ 43.5
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