Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BECN1Q14457 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BECN1Q14457 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BECN1Q14457 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BECN1Q14457 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BECN1Q14457 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BECN1Q14457 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BECN1Q14457 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BECN1Q14457 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BECN1Q14457 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BECN1Q14457 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BECN1Q14457 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BECN1Q14457 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BECN1Q14457 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BECN1Q14457 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BECN1Q14457 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
BECN1Q14457 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
BECN1Q14457 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BECN1Q14457 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BECN1Q14457 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BECN1Q14457 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BECN1Q14457 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BECN1Q14457 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BECN1Q14457 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BECN1Q14457 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BECN1Q14457 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BECN1Q14457 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BECN1Q14457 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BECN1Q14457 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BECN1Q14457 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BECN1Q14457 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BECN1Q14457 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
BECN1Q14457 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BECN1Q14457 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BECN1Q14457 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
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