Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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