Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCINQ13939 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCINQ13939 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCINQ13939 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCINQ13939 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCINQ13939 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCINQ13939 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCINQ13939 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCINQ13939 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCINQ13939 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCINQ13939 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCINQ13939 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCINQ13939 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCINQ13939 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCINQ13939 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCINQ13939 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCINQ13939 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCINQ13939 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCINQ13939 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCINQ13939 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCINQ13939 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCINQ13939 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCINQ13939 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCINQ13939 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCINQ13939 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCINQ13939 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCINQ13939 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCINQ13939 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCINQ13939 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCINQ13939 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCINQ13939 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCINQ13939 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCINQ13939 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCINQ13939 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCINQ13939 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCINQ13939 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCINQ13939 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCINQ13939 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCINQ13939 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCINQ13939 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCINQ13939 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCINQ13939 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCINQ13939 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCINQ13939 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCINQ13939 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCINQ13939 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCINQ13939 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCINQ13939 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCINQ13939 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCINQ13939 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCINQ13939 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCINQ13939 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCINQ13939 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCINQ13939 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCINQ13939 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCINQ13939 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCINQ13939 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCINQ13939 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCINQ13939 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCINQ13939 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCINQ13939 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCINQ13939 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCINQ13939 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCINQ13939 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCINQ13939 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCINQ13939 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCINQ13939 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCINQ13939 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCINQ13939 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCINQ13939 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCINQ13939 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCINQ13939 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCINQ13939 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCINQ13939 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCINQ13939 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCINQ13939 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCINQ13939 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCINQ13939 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCINQ13939 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCINQ13939 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCINQ13939 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCINQ13939 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCINQ13939 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCINQ13939 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCINQ13939 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCINQ13939 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCINQ13939 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCINQ13939 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCINQ13939 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCINQ13939 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCINQ13939 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCINQ13939 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCINQ13939 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCINQ13939 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCINQ13939 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCINQ13939 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCINQ13939 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCINQ13939 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCINQ13939 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCINQ13939 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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