Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms