Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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CUL3Q13618 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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CUL3Q13618 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CUL3Q13618 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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CUL3Q13618 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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