Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDE3BQ13370 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
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