Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms