Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALCOCO2Q13137 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms