Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF1Q13077 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF1Q13077 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
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