Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TROQ12816 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TROQ12816 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TROQ12816 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TROQ12816 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TROQ12816 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TROQ12816 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TROQ12816 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TROQ12816 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TROQ12816 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TROQ12816 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TROQ12816 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TROQ12816 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TROQ12816 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TROQ12816 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TROQ12816 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
TROQ12816 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TROQ12816 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TROQ12816 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
TROQ12816 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
TROQ12816 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TROQ12816 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TROQ12816 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TROQ12816 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TROQ12816 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TROQ12816 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TROQ12816 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
TROQ12816 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TROQ12816 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TROQ12816 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TROQ12816 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TROQ12816 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TROQ12816 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TROQ12816 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
TROQ12816 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TROQ12816 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TROQ12816 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TROQ12816 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TROQ12816 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TROQ12816 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TROQ12816 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TROQ12816 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TROQ12816 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
TROQ12816 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TROQ12816 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TROQ12816 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TROQ12816 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TROQ12816 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TROQ12816 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
TROQ12816 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TROQ12816 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TROQ12816 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
TROQ12816 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TROQ12816 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TROQ12816 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TROQ12816 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TROQ12816 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TROQ12816 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TROQ12816 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TROQ12816 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TROQ12816 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TROQ12816 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TROQ12816 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
TROQ12816 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
TROQ12816 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TROQ12816 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TROQ12816 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TROQ12816 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
TROQ12816 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TROQ12816 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TROQ12816 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
TROQ12816 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
TROQ12816 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TROQ12816 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TROQ12816 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TROQ12816 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TROQ12816 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TROQ12816 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TROQ12816 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TROQ12816 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TROQ12816 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TROQ12816 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
TROQ12816 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TROQ12816 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TROQ12816 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TROQ12816 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TROQ12816 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TROQ12816 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TROQ12816 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TROQ12816 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TROQ12816 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TROQ12816 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TROQ12816 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TROQ12816 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TROQ12816 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TROQ12816 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TROQ12816 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TROQ12816 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TROQ12816 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
TROQ12816 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
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