Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
EP300Q09472 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EP300Q09472 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EP300Q09472 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EP300Q09472 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EP300Q09472 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EP300Q09472 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EP300Q09472 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EP300Q09472 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EP300Q09472 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EP300Q09472 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EP300Q09472 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EP300Q09472 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EP300Q09472 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EP300Q09472 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EP300Q09472 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EP300Q09472 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EP300Q09472 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EP300Q09472 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EP300Q09472 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EP300Q09472 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EP300Q09472 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EP300Q09472 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EP300Q09472 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EP300Q09472 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EP300Q09472 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EP300Q09472 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EP300Q09472 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EP300Q09472 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EP300Q09472 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EP300Q09472 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EP300Q09472 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EP300Q09472 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EP300Q09472 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EP300Q09472 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EP300Q09472 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EP300Q09472 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EP300Q09472 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EP300Q09472 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EP300Q09472 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EP300Q09472 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EP300Q09472 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EP300Q09472 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EP300Q09472 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EP300Q09472 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EP300Q09472 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EP300Q09472 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EP300Q09472 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EP300Q09472 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EP300Q09472 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EP300Q09472 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EP300Q09472 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EP300Q09472 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EP300Q09472 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EP300Q09472 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EP300Q09472 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EP300Q09472 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EP300Q09472 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EP300Q09472 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EP300Q09472 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EP300Q09472 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EP300Q09472 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EP300Q09472 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EP300Q09472 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EP300Q09472 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EP300Q09472 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EP300Q09472 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EP300Q09472 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EP300Q09472 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EP300Q09472 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
EP300Q09472 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
EP300Q09472 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
EP300Q09472 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EP300Q09472 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EP300Q09472 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EP300Q09472 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EP300Q09472 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EP300Q09472 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EP300Q09472 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EP300Q09472 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EP300Q09472 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EP300Q09472 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EP300Q09472 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EP300Q09472 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EP300Q09472 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EP300Q09472 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EP300Q09472 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EP300Q09472 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EP300Q09472 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EP300Q09472 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EP300Q09472 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EP300Q09472 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EP300Q09472 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EP300Q09472 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EP300Q09472 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EP300Q09472 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EP300Q09472 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EP300Q09472 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EP300Q09472 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EP300Q09472 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms