Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
DDR1Q08345 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms