Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms