Protein–RNA interactions for Protein: Q07020

RPL18, 60S ribosomal protein L18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18Q07020 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPL18Q07020 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL18Q07020 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms