Protein–RNA interactions for Protein: Q01814

ATP2B2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B2Q01814 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B2Q01814 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B2Q01814 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms