Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MC1RQ01726 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MC1RQ01726 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MC1RQ01726 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MC1RQ01726 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MC1RQ01726 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MC1RQ01726 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MC1RQ01726 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MC1RQ01726 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MC1RQ01726 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MC1RQ01726 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MC1RQ01726 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MC1RQ01726 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MC1RQ01726 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MC1RQ01726 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MC1RQ01726 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MC1RQ01726 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MC1RQ01726 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MC1RQ01726 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MC1RQ01726 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MC1RQ01726 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MC1RQ01726 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MC1RQ01726 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MC1RQ01726 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MC1RQ01726 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MC1RQ01726 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MC1RQ01726 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms