Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
HDLBPQ00341 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms