Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TPM4P67936 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPM4P67936 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPM4P67936 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPM4P67936 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPM4P67936 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPM4P67936 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPM4P67936 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPM4P67936 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPM4P67936 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPM4P67936 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPM4P67936 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPM4P67936 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPM4P67936 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPM4P67936 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPM4P67936 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPM4P67936 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPM4P67936 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPM4P67936 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPM4P67936 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPM4P67936 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPM4P67936 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPM4P67936 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPM4P67936 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPM4P67936 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPM4P67936 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TPM4P67936 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TPM4P67936 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPM4P67936 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TPM4P67936 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPM4P67936 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPM4P67936 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPM4P67936 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPM4P67936 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPM4P67936 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPM4P67936 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPM4P67936 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPM4P67936 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPM4P67936 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPM4P67936 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPM4P67936 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPM4P67936 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPM4P67936 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPM4P67936 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPM4P67936 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPM4P67936 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPM4P67936 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPM4P67936 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPM4P67936 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPM4P67936 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPM4P67936 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPM4P67936 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPM4P67936 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPM4P67936 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPM4P67936 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPM4P67936 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPM4P67936 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPM4P67936 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPM4P67936 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPM4P67936 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TPM4P67936 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPM4P67936 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TPM4P67936 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TPM4P67936 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TPM4P67936 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPM4P67936 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPM4P67936 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPM4P67936 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPM4P67936 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPM4P67936 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TPM4P67936 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TPM4P67936 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPM4P67936 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPM4P67936 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPM4P67936 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPM4P67936 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPM4P67936 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPM4P67936 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPM4P67936 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPM4P67936 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPM4P67936 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPM4P67936 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPM4P67936 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPM4P67936 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPM4P67936 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPM4P67936 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPM4P67936 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPM4P67936 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPM4P67936 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPM4P67936 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPM4P67936 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPM4P67936 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPM4P67936 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPM4P67936 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPM4P67936 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPM4P67936 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPM4P67936 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPM4P67936 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPM4P67936 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPM4P67936 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms