Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMC1P62191 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMC1P62191 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms