Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCS1P62166 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NCS1P62166 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NCS1P62166 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCS1P62166 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCS1P62166 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCS1P62166 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCS1P62166 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCS1P62166 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCS1P62166 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCS1P62166 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCS1P62166 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCS1P62166 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCS1P62166 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCS1P62166 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCS1P62166 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCS1P62166 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCS1P62166 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCS1P62166 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCS1P62166 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCS1P62166 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCS1P62166 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCS1P62166 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCS1P62166 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCS1P62166 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCS1P62166 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCS1P62166 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCS1P62166 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCS1P62166 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCS1P62166 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCS1P62166 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCS1P62166 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCS1P62166 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCS1P62166 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCS1P62166 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCS1P62166 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCS1P62166 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCS1P62166 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCS1P62166 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCS1P62166 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCS1P62166 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCS1P62166 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCS1P62166 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCS1P62166 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCS1P62166 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCS1P62166 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCS1P62166 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCS1P62166 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCS1P62166 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCS1P62166 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCS1P62166 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCS1P62166 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCS1P62166 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCS1P62166 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCS1P62166 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCS1P62166 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCS1P62166 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCS1P62166 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCS1P62166 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCS1P62166 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCS1P62166 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCS1P62166 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCS1P62166 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCS1P62166 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCS1P62166 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCS1P62166 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCS1P62166 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCS1P62166 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCS1P62166 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCS1P62166 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCS1P62166 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCS1P62166 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCS1P62166 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCS1P62166 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCS1P62166 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NCS1P62166 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCS1P62166 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCS1P62166 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCS1P62166 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCS1P62166 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCS1P62166 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NCS1P62166 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCS1P62166 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCS1P62166 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCS1P62166 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCS1P62166 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCS1P62166 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCS1P62166 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCS1P62166 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCS1P62166 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCS1P62166 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCS1P62166 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCS1P62166 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCS1P62166 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCS1P62166 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCS1P62166 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCS1P62166 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCS1P62166 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCS1P62166 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCS1P62166 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms