Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms