Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX5P50542 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX5P50542 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX5P50542 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX5P50542 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX5P50542 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX5P50542 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX5P50542 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX5P50542 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX5P50542 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX5P50542 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX5P50542 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX5P50542 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX5P50542 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX5P50542 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX5P50542 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX5P50542 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX5P50542 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX5P50542 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX5P50542 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX5P50542 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX5P50542 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX5P50542 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX5P50542 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX5P50542 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX5P50542 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX5P50542 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX5P50542 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX5P50542 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX5P50542 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX5P50542 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX5P50542 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX5P50542 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX5P50542 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX5P50542 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX5P50542 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX5P50542 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX5P50542 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX5P50542 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX5P50542 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX5P50542 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX5P50542 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX5P50542 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX5P50542 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX5P50542 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX5P50542 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX5P50542 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX5P50542 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX5P50542 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX5P50542 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX5P50542 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX5P50542 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX5P50542 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX5P50542 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX5P50542 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX5P50542 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX5P50542 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX5P50542 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX5P50542 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX5P50542 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX5P50542 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX5P50542 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX5P50542 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX5P50542 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX5P50542 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX5P50542 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX5P50542 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX5P50542 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX5P50542 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX5P50542 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX5P50542 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX5P50542 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX5P50542 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX5P50542 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX5P50542 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX5P50542 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX5P50542 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX5P50542 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX5P50542 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX5P50542 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX5P50542 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX5P50542 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX5P50542 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX5P50542 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX5P50542 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX5P50542 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX5P50542 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX5P50542 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX5P50542 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX5P50542 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX5P50542 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX5P50542 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX5P50542 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX5P50542 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX5P50542 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX5P50542 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX5P50542 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX5P50542 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX5P50542 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX5P50542 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms