Protein–RNA interactions for Protein: P49913

CAMP, Cathelicidin antimicrobial peptide, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMPP49913 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMPP49913 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMPP49913 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMPP49913 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMPP49913 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMPP49913 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMPP49913 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMPP49913 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMPP49913 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMPP49913 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMPP49913 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMPP49913 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMPP49913 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMPP49913 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMPP49913 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMPP49913 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMPP49913 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMPP49913 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMPP49913 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMPP49913 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMPP49913 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMPP49913 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMPP49913 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMPP49913 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMPP49913 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMPP49913 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMPP49913 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMPP49913 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMPP49913 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMPP49913 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMPP49913 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMPP49913 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMPP49913 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMPP49913 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMPP49913 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMPP49913 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMPP49913 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMPP49913 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMPP49913 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
CAMPP49913 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CAMPP49913 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMPP49913 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMPP49913 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMPP49913 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMPP49913 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMPP49913 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMPP49913 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMPP49913 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMPP49913 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMPP49913 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMPP49913 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMPP49913 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMPP49913 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMPP49913 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMPP49913 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMPP49913 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMPP49913 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMPP49913 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMPP49913 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMPP49913 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMPP49913 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMPP49913 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMPP49913 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMPP49913 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAMPP49913 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMPP49913 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMPP49913 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMPP49913 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMPP49913 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMPP49913 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMPP49913 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMPP49913 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMPP49913 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMPP49913 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMPP49913 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMPP49913 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMPP49913 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMPP49913 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMPP49913 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMPP49913 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMPP49913 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMPP49913 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMPP49913 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMPP49913 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMPP49913 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMPP49913 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMPP49913 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAMPP49913 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMPP49913 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMPP49913 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMPP49913 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMPP49913 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMPP49913 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMPP49913 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMPP49913 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMPP49913 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMPP49913 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMPP49913 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMPP49913 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMPP49913 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms