Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PRIM1P49642 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRIM1P49642 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms