Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC37.84■■■■□ 3.65
NESP48681 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
NESP48681 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NESP48681 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
NESP48681 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
NESP48681 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
NESP48681 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
NESP48681 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
NESP48681 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
NESP48681 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC37.83■■■■□ 3.65
NESP48681 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NESP48681 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NESP48681 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NESP48681 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NESP48681 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
NESP48681 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
NESP48681 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
NESP48681 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
NESP48681 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
NESP48681 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
NESP48681 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
NESP48681 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
NESP48681 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC37.82■■■■□ 3.64
NESP48681 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
NESP48681 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
NESP48681 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
NESP48681 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC37.81■■■■□ 3.64
NESP48681 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
NESP48681 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
NESP48681 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
NESP48681 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NESP48681 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
NESP48681 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
NESP48681 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NESP48681 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NESP48681 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NESP48681 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NESP48681 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NESP48681 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NESP48681 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC37.79■■■■□ 3.64
NESP48681 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
NESP48681 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
NESP48681 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
NESP48681 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
NESP48681 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
NESP48681 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
NESP48681 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
NESP48681 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
NESP48681 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
NESP48681 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
NESP48681 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NESP48681 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NESP48681 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
NESP48681 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
NESP48681 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NESP48681 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
NESP48681 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
NESP48681 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
NESP48681 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
NESP48681 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
NESP48681 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
NESP48681 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
NESP48681 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
NESP48681 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
NESP48681 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
NESP48681 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
NESP48681 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
NESP48681 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
NESP48681 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC37.76■■■■□ 3.63
NESP48681 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
NESP48681 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NESP48681 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
NESP48681 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NESP48681 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NESP48681 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NESP48681 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NESP48681 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NESP48681 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
NESP48681 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NESP48681 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NESP48681 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NESP48681 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NESP48681 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
NESP48681 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NESP48681 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
NESP48681 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
NESP48681 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
NESP48681 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NESP48681 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NESP48681 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
NESP48681 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
NESP48681 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
NESP48681 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
NESP48681 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
NESP48681 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC37.72■■■■□ 3.63
NESP48681 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
NESP48681 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
NESP48681 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC37.72■■■■□ 3.63
NESP48681 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NESP48681 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms