Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
GCLCP48506 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GCLCP48506 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCLCP48506 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCLCP48506 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCLCP48506 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCLCP48506 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCLCP48506 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCLCP48506 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCLCP48506 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCLCP48506 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCLCP48506 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCLCP48506 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCLCP48506 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCLCP48506 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCLCP48506 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCLCP48506 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GCLCP48506 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCLCP48506 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCLCP48506 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCLCP48506 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCLCP48506 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCLCP48506 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCLCP48506 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCLCP48506 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCLCP48506 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCLCP48506 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCLCP48506 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCLCP48506 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCLCP48506 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCLCP48506 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GCLCP48506 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GCLCP48506 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCLCP48506 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCLCP48506 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCLCP48506 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCLCP48506 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCLCP48506 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCLCP48506 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCLCP48506 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GCLCP48506 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCLCP48506 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCLCP48506 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCLCP48506 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCLCP48506 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCLCP48506 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCLCP48506 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCLCP48506 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCLCP48506 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCLCP48506 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCLCP48506 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCLCP48506 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCLCP48506 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCLCP48506 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCLCP48506 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCLCP48506 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCLCP48506 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCLCP48506 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCLCP48506 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GCLCP48506 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCLCP48506 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCLCP48506 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCLCP48506 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCLCP48506 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCLCP48506 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCLCP48506 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCLCP48506 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCLCP48506 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCLCP48506 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCLCP48506 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCLCP48506 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCLCP48506 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCLCP48506 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCLCP48506 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GCLCP48506 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCLCP48506 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCLCP48506 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCLCP48506 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCLCP48506 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCLCP48506 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCLCP48506 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCLCP48506 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCLCP48506 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCLCP48506 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCLCP48506 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCLCP48506 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCLCP48506 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCLCP48506 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCLCP48506 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GCLCP48506 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCLCP48506 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCLCP48506 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCLCP48506 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCLCP48506 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCLCP48506 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCLCP48506 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCLCP48506 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCLCP48506 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCLCP48506 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCLCP48506 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms