Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRATP43155 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CRATP43155 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRATP43155 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRATP43155 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRATP43155 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRATP43155 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRATP43155 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRATP43155 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRATP43155 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRATP43155 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CRATP43155 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRATP43155 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRATP43155 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRATP43155 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRATP43155 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRATP43155 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRATP43155 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRATP43155 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRATP43155 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRATP43155 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRATP43155 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRATP43155 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRATP43155 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRATP43155 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRATP43155 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CRATP43155 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CRATP43155 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRATP43155 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRATP43155 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRATP43155 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRATP43155 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CRATP43155 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CRATP43155 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CRATP43155 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRATP43155 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRATP43155 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRATP43155 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRATP43155 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRATP43155 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRATP43155 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRATP43155 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRATP43155 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRATP43155 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRATP43155 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRATP43155 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRATP43155 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRATP43155 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRATP43155 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRATP43155 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRATP43155 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRATP43155 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRATP43155 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRATP43155 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRATP43155 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRATP43155 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRATP43155 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CRATP43155 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRATP43155 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CRATP43155 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRATP43155 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRATP43155 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRATP43155 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRATP43155 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRATP43155 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRATP43155 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRATP43155 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRATP43155 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRATP43155 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRATP43155 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRATP43155 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRATP43155 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRATP43155 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRATP43155 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRATP43155 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRATP43155 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRATP43155 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRATP43155 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRATP43155 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRATP43155 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRATP43155 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRATP43155 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CRATP43155 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRATP43155 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRATP43155 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRATP43155 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRATP43155 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRATP43155 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRATP43155 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRATP43155 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRATP43155 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRATP43155 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRATP43155 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRATP43155 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRATP43155 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRATP43155 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRATP43155 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRATP43155 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRATP43155 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRATP43155 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms