Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL35P42766 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL35P42766 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL35P42766 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL35P42766 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL35P42766 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL35P42766 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL35P42766 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL35P42766 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL35P42766 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL35P42766 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL35P42766 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL35P42766 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL35P42766 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL35P42766 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL35P42766 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL35P42766 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL35P42766 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL35P42766 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL35P42766 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL35P42766 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL35P42766 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL35P42766 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL35P42766 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL35P42766 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL35P42766 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL35P42766 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL35P42766 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL35P42766 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL35P42766 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL35P42766 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL35P42766 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL35P42766 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL35P42766 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL35P42766 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL35P42766 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL35P42766 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL35P42766 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL35P42766 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL35P42766 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL35P42766 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL35P42766 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL35P42766 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL35P42766 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL35P42766 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL35P42766 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL35P42766 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL35P42766 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL35P42766 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL35P42766 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL35P42766 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL35P42766 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL35P42766 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL35P42766 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL35P42766 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL35P42766 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL35P42766 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL35P42766 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL35P42766 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL35P42766 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL35P42766 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL35P42766 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL35P42766 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL35P42766 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL35P42766 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL35P42766 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL35P42766 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL35P42766 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL35P42766 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL35P42766 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL35P42766 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL35P42766 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL35P42766 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL35P42766 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL35P42766 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL35P42766 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL35P42766 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL35P42766 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL35P42766 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL35P42766 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL35P42766 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL35P42766 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL35P42766 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL35P42766 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL35P42766 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL35P42766 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL35P42766 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL35P42766 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL35P42766 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL35P42766 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL35P42766 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL35P42766 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL35P42766 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL35P42766 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL35P42766 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL35P42766 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL35P42766 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL35P42766 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL35P42766 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL35P42766 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms