Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA3P42263 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA3P42263 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA3P42263 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA3P42263 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA3P42263 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA3P42263 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA3P42263 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA3P42263 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA3P42263 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIA3P42263 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIA3P42263 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIA3P42263 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIA3P42263 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIA3P42263 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA3P42263 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms