Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXA10P31260 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA10P31260 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms