Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms