Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms