Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms