Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMOD1P29536 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LMOD1P29536 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms