Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRZ1P23471 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRZ1P23471 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRZ1P23471 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRZ1P23471 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRZ1P23471 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRZ1P23471 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRZ1P23471 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRZ1P23471 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRZ1P23471 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRZ1P23471 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRZ1P23471 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRZ1P23471 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRZ1P23471 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRZ1P23471 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRZ1P23471 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRZ1P23471 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRZ1P23471 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRZ1P23471 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRZ1P23471 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms