Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms