Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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PDE6GP18545 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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PDE6GP18545 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDE6GP18545 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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