Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMD1P17707 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMD1P17707 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMD1P17707 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMD1P17707 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMD1P17707 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMD1P17707 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMD1P17707 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMD1P17707 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMD1P17707 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMD1P17707 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMD1P17707 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMD1P17707 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMD1P17707 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AMD1P17707 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AMD1P17707 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AMD1P17707 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
AMD1P17707 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AMD1P17707 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
AMD1P17707 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
AMD1P17707 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMD1P17707 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMD1P17707 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMD1P17707 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMD1P17707 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMD1P17707 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMD1P17707 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMD1P17707 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMD1P17707 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMD1P17707 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMD1P17707 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMD1P17707 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMD1P17707 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMD1P17707 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMD1P17707 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMD1P17707 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMD1P17707 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
AMD1P17707 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMD1P17707 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMD1P17707 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMD1P17707 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMD1P17707 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
AMD1P17707 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMD1P17707 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMD1P17707 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMD1P17707 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMD1P17707 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMD1P17707 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMD1P17707 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMD1P17707 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMD1P17707 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMD1P17707 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMD1P17707 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMD1P17707 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMD1P17707 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMD1P17707 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMD1P17707 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMD1P17707 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMD1P17707 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMD1P17707 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMD1P17707 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMD1P17707 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMD1P17707 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMD1P17707 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMD1P17707 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMD1P17707 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMD1P17707 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMD1P17707 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMD1P17707 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMD1P17707 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMD1P17707 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMD1P17707 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMD1P17707 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMD1P17707 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMD1P17707 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
AMD1P17707 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
AMD1P17707 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMD1P17707 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMD1P17707 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMD1P17707 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMD1P17707 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMD1P17707 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMD1P17707 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
AMD1P17707 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMD1P17707 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMD1P17707 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMD1P17707 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMD1P17707 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMD1P17707 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMD1P17707 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMD1P17707 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMD1P17707 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMD1P17707 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMD1P17707 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMD1P17707 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
AMD1P17707 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMD1P17707 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMD1P17707 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMD1P17707 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMD1P17707 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms