Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB4P17483 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms