Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
UBTFP17480 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
UBTFP17480 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
UBTFP17480 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
UBTFP17480 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
UBTFP17480 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
UBTFP17480 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
UBTFP17480 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
UBTFP17480 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
UBTFP17480 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
UBTFP17480 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
UBTFP17480 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
UBTFP17480 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
UBTFP17480 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
UBTFP17480 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
UBTFP17480 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
UBTFP17480 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
UBTFP17480 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
UBTFP17480 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
UBTFP17480 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
UBTFP17480 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
UBTFP17480 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
UBTFP17480 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
UBTFP17480 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
UBTFP17480 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
UBTFP17480 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
UBTFP17480 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
UBTFP17480 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
UBTFP17480 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
UBTFP17480 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC34.9■■■■□ 3.18
UBTFP17480 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
UBTFP17480 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
UBTFP17480 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
UBTFP17480 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
UBTFP17480 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
UBTFP17480 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
UBTFP17480 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
UBTFP17480 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
UBTFP17480 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
UBTFP17480 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
UBTFP17480 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
UBTFP17480 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
UBTFP17480 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
UBTFP17480 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
UBTFP17480 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
UBTFP17480 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
UBTFP17480 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
UBTFP17480 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
UBTFP17480 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
UBTFP17480 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
UBTFP17480 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
UBTFP17480 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
UBTFP17480 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
UBTFP17480 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
UBTFP17480 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
UBTFP17480 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
UBTFP17480 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
UBTFP17480 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
UBTFP17480 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
UBTFP17480 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
UBTFP17480 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
UBTFP17480 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
UBTFP17480 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
UBTFP17480 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
UBTFP17480 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
UBTFP17480 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
UBTFP17480 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
UBTFP17480 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
UBTFP17480 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
UBTFP17480 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
UBTFP17480 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
UBTFP17480 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
UBTFP17480 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
UBTFP17480 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
UBTFP17480 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
UBTFP17480 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
UBTFP17480 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
UBTFP17480 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
UBTFP17480 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
UBTFP17480 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
UBTFP17480 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
UBTFP17480 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
UBTFP17480 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
UBTFP17480 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
UBTFP17480 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
UBTFP17480 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
UBTFP17480 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
UBTFP17480 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
UBTFP17480 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
UBTFP17480 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
UBTFP17480 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
UBTFP17480 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
UBTFP17480 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
UBTFP17480 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
UBTFP17480 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
UBTFP17480 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
UBTFP17480 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
UBTFP17480 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
UBTFP17480 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
UBTFP17480 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms