Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCL3L1P16619 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 263 ms