Protein–RNA interactions for Protein: P16104

H2AFX, Histone H2AX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFXP16104 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
H2AFXP16104 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFXP16104 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms