Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COX6A1P12074 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms