Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEFHP12036 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEFHP12036 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEFHP12036 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEFHP12036 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEFHP12036 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEFHP12036 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEFHP12036 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEFHP12036 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEFHP12036 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEFHP12036 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEFHP12036 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEFHP12036 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEFHP12036 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEFHP12036 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEFHP12036 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEFHP12036 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEFHP12036 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEFHP12036 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEFHP12036 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEFHP12036 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEFHP12036 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEFHP12036 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEFHP12036 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEFHP12036 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEFHP12036 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NEFHP12036 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEFHP12036 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEFHP12036 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NEFHP12036 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEFHP12036 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEFHP12036 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NEFHP12036 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEFHP12036 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEFHP12036 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEFHP12036 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEFHP12036 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEFHP12036 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEFHP12036 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEFHP12036 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEFHP12036 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NEFHP12036 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEFHP12036 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEFHP12036 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEFHP12036 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEFHP12036 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEFHP12036 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEFHP12036 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEFHP12036 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEFHP12036 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEFHP12036 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEFHP12036 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEFHP12036 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEFHP12036 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEFHP12036 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEFHP12036 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEFHP12036 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEFHP12036 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEFHP12036 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEFHP12036 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEFHP12036 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEFHP12036 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEFHP12036 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEFHP12036 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEFHP12036 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEFHP12036 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEFHP12036 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEFHP12036 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NEFHP12036 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEFHP12036 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEFHP12036 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEFHP12036 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEFHP12036 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEFHP12036 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEFHP12036 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEFHP12036 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEFHP12036 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEFHP12036 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEFHP12036 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEFHP12036 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEFHP12036 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEFHP12036 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEFHP12036 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEFHP12036 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEFHP12036 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEFHP12036 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEFHP12036 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEFHP12036 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEFHP12036 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEFHP12036 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEFHP12036 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEFHP12036 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEFHP12036 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEFHP12036 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NEFHP12036 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEFHP12036 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEFHP12036 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEFHP12036 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEFHP12036 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEFHP12036 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms