Protein–RNA interactions for Protein: P10619

CTSA, Lysosomal protective protein, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSAP10619 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSAP10619 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSAP10619 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSAP10619 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSAP10619 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSAP10619 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSAP10619 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSAP10619 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSAP10619 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSAP10619 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSAP10619 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSAP10619 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSAP10619 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSAP10619 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSAP10619 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSAP10619 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSAP10619 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSAP10619 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSAP10619 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSAP10619 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSAP10619 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSAP10619 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSAP10619 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTSAP10619 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTSAP10619 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSAP10619 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSAP10619 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSAP10619 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSAP10619 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSAP10619 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSAP10619 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSAP10619 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSAP10619 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSAP10619 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSAP10619 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSAP10619 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSAP10619 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSAP10619 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSAP10619 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSAP10619 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSAP10619 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSAP10619 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSAP10619 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSAP10619 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSAP10619 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSAP10619 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSAP10619 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSAP10619 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSAP10619 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSAP10619 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSAP10619 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSAP10619 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSAP10619 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSAP10619 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSAP10619 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSAP10619 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSAP10619 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSAP10619 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSAP10619 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSAP10619 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSAP10619 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSAP10619 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSAP10619 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSAP10619 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSAP10619 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSAP10619 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSAP10619 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSAP10619 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSAP10619 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSAP10619 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSAP10619 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSAP10619 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSAP10619 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSAP10619 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSAP10619 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSAP10619 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSAP10619 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSAP10619 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSAP10619 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSAP10619 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSAP10619 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSAP10619 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSAP10619 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSAP10619 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSAP10619 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSAP10619 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSAP10619 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSAP10619 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSAP10619 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSAP10619 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSAP10619 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSAP10619 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSAP10619 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSAP10619 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSAP10619 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSAP10619 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSAP10619 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSAP10619 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSAP10619 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSAP10619 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms